Trình chặn quảng cáo đang nổi lên như một công cụ bất ngờ nhưng hữu ích trong cuộc chiến chống phần mềm gián điệp, đặc biệt trong bối cảnh các nghiên cứu gần đây cho thấy các nhà sản xuất phần mềm độc hại sử dụng quảng cáo trên web để hỗ trợ hoạt động giám sát của chính phủ. Các doanh nghiệp phần mềm gián điệp đã bị phát hiện khi sử dụng các biểu ngữ quảng cáo để bí mật lây nhiễm phần mềm nguy hiểm cho những người cụ thể. Một công ty như vậy, Intellexa, một công ty khởi nghiệp ở châu Âu, đã tạo ra phần mềm độc hại Predator, có thể truy cập tất cả dữ liệu trên điện thoại thông minh của mục tiêu trong thời gian thực. Theo Haaretz, một hãng tin Isreali, Intellexa đã ra mắt một thiết bị nguyên mẫu có tên Aladdin vào năm 2022, minh họa cách cài đặt phần mềm gián điệp thông qua quảng cáo trên web. Hệ thống nhắm mục tiêu vào các cá nhân bằng các lời mời làm việc được cá nhân hóa trong quảng cáo, điều này có thể làm tổn hại đến thiết bị của họ. Mức độ triển khai của Aladdin vẫn chưa được biết.
Theo Haaretz, một công ty khởi nghiệp khác của Israel, Insanet, đã phát triển thành công một hệ thống phát hiện những người trong mạng quảng cáo và triển khai phần mềm gián điệp. Mặc dù quảng cáo trên internet là nguồn kiếm tiền quan trọng đối với nhiều trang web nhưng chúng cũng có thể được sử dụng để gửi mã độc. Quảng cáo độc hại, hay kỹ thuật nhúng phần mềm độc hại vào quảng cáo, thường yêu cầu thông tin đầu vào của người dùng để lây nhiễm vào thiết bị, tuy nhiên nó vẫn là mối nguy hiểm đáng kể do sự phổ biến của quảng cáo trên internet.
Mặc dù khó có thể bảo vệ hoàn toàn điện thoại và máy tính khỏi bị tấn công nhưng khối quảng cáo có thể giảm đáng kể nguy cơ quảng cáo độc hại và phần mềm độc hại do quảng cáo gây ra bằng cách ngăn quảng cáo tải vào trình duyệt. Điều này không chỉ bảo vệ khỏi phần mềm độc hại mà còn cải thiện quyền riêng tư bằng cách ngăn chặn mã theo dõi được các mạng quảng cáo sử dụng. Phần mềm chặn quảng cáo thường được các chuyên gia bảo mật khuyên dùng và có sẵn cho cả trình duyệt trên máy tính để bàn và thiết bị di động. Trước những lo ngại này, các tổ chức như FBI đã kêu gọi sử dụng các trình chặn quảng cáo như một biện pháp phòng ngừa trong bảo mật kỹ thuật số.